El Comandante en Jefe de la Alianza era quien se encontraba a cargo de las fuerzas armadas de la Alianza Rebelde. Este controlaba todos los aspectos de las Fuerzas Armadas de la Alianza. Mon Mothma fue la única Comandante ej Jefe de la Alianza, que después se transformó en la Alianza de Planetas Libres.
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